Příběh se opět točí převážně kolem Solid Snakea, který je nyní známý jakožto Old Snake. Odehrává se 5 let po událostech druhého dílu a hlavní hrdina se vydává na poslední misi. Cílem je jeho úhlavní nepřítel, kterému se zatím vždy podařilo uniknout - Liquid Snake.
Další díly:
Vývojář/vydavatel: Konami