Alex Mercer je stíhaný svou temnou minulostí, která se ho ne a ne pustit. Problém je v tom, že Alex není obyčejný člověk, jedná se o geneticky zmutovaného jedince, jemuž byla kompletně vymazána paměť. Nejen z toho důvodu vede ve městě New York vlastní tajnou válku. Situace se však začne postupem času vyvíjet nepříliš příznivým směrem, což vyústí až do ohrožení budoucnosti celého lidstva nebezpečným virem.
Hlavní hrdina, v jehož kůži si celou hru projdete, není žádné ořezávátko, jak se ostatně můžete dovtípit z výše zmíněných informací. Díky oné mutaci získal spoustu speciálních vlastností. Kombinací několika genetických znaků vám tak rázem mohou narůst velké železné drápy, nebo ocelová kůže. Do vínku se vám dostanou také nevídané akrobatické schopnosti. Po městě se budete pohybovat pomocí, tzn. parkouru, což je takovéto veselé hopsání přes všechny překážky, co vám železobetonová džungle postaví do cesty.
Když už jsme se dostali k tomu městu, slušelo by se dodat, že virtuální New York jako by z oka vypadl tomu skutečnému. Nejen co se týče architektury, ale i celkového života. Na ulicích potkáte stovky civilistů a vozidel, tentokrát navíc doplněny o vojenskou techniku typu vrtulník Apache či tank Abrams. To vše dostanete zabalené v povedeném grafickém kabátku v průběhu příštího roku na PS3, X360 a PC.
